Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pramef12Q9D2F1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms