Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2cQ9D1C1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms