Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R4

Ddx56, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddx56Q9D0R4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx56Q9D0R4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx56Q9D0R4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ddx56Q9D0R4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ddx56Q9D0R4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ddx56Q9D0R4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ddx56Q9D0R4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx56Q9D0R4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ddx56Q9D0R4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx56Q9D0R4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx56Q9D0R4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx56Q9D0R4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ddx56Q9D0R4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx56Q9D0R4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx56Q9D0R4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx56Q9D0R4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx56Q9D0R4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx56Q9D0R4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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