Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms