Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrs1Q9CYH6 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms