Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms