Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ddx28Q9CWT6 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ddx28Q9CWT6 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ddx28Q9CWT6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ddx28Q9CWT6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ddx28Q9CWT6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddx28Q9CWT6 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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