Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS8

Sec61b, Protein transport protein Sec61 subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec61bQ9CQS8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Gm7340-201ENSMUST00000119729 2752 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
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Sec61bQ9CQS8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Sec61bQ9CQS8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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Sec61bQ9CQS8 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm39307-201ENSMUST00000216780 1037 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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