Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms