Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms