Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdm1Q9CQK3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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