Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms