Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
1700029P11RikQ9CQ68 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms