Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms