Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf8Q99PV0 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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