Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrbp1Q99PL5 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms