Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nup155Q99P88 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms