Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b1Q99NB9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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