Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac9Q99N13 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms