Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chmp1b1Q99LU0 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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