Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms