Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf19Q99KP6 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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