Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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