Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc8b1Q925Q3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms