Protein–RNA interactions for Protein: Q91WU4

Tmco4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco4Q91WU4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmco4Q91WU4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco4Q91WU4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco4Q91WU4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco4Q91WU4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco4Q91WU4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco4Q91WU4 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmco4Q91WU4 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmco4Q91WU4 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco4Q91WU4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco4Q91WU4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco4Q91WU4 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco4Q91WU4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco4Q91WU4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco4Q91WU4 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco4Q91WU4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco4Q91WU4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco4Q91WU4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco4Q91WU4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco4Q91WU4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco4Q91WU4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco4Q91WU4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco4Q91WU4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms