Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cabp4Q8VHC5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms