Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smg8Q8VE18 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms