Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ttc8Q8VD72 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ttc8Q8VD72 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms