Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Trappc12Q8K2L8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Trappc12Q8K2L8 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Trappc12Q8K2L8 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Trappc12Q8K2L8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Trappc12Q8K2L8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Trappc12Q8K2L8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Trappc12Q8K2L8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Trappc12Q8K2L8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms