Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc4a8Q8JZR6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms