Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LgsnQ8CIX8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms