Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Csnka2ipQ8CH19 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Csnka2ipQ8CH19 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Csnka2ipQ8CH19 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Csnka2ipQ8CH19 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Csnka2ipQ8CH19 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Csnka2ipQ8CH19 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Csnka2ipQ8CH19 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Csnka2ipQ8CH19 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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