Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Hpf1Q8CFE2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Hpf1Q8CFE2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Hpf1Q8CFE2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hpf1Q8CFE2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Hpf1Q8CFE2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Hpf1Q8CFE2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Hpf1Q8CFE2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Hpf1Q8CFE2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Hpf1Q8CFE2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Hpf1Q8CFE2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Hpf1Q8CFE2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Hpf1Q8CFE2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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