Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx8Q8CFD4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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