Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms