Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4933409G03RikQ8C5U0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms