Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R9

Lrrd1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrd1Q8C0R9 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrd1Q8C0R9 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrd1Q8C0R9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrd1Q8C0R9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrd1Q8C0R9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrd1Q8C0R9 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrd1Q8C0R9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrd1Q8C0R9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrd1Q8C0R9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrd1Q8C0R9 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrd1Q8C0R9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrd1Q8C0R9 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrd1Q8C0R9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrd1Q8C0R9 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrd1Q8C0R9 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrd1Q8C0R9 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrd1Q8C0R9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Lrrd1Q8C0R9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Lrrd1Q8C0R9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Lrrd1Q8C0R9 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrd1Q8C0R9 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrd1Q8C0R9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrd1Q8C0R9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrd1Q8C0R9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrd1Q8C0R9 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrd1Q8C0R9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Lrrd1Q8C0R9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrd1Q8C0R9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrd1Q8C0R9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrd1Q8C0R9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrd1Q8C0R9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrd1Q8C0R9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrd1Q8C0R9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrd1Q8C0R9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrd1Q8C0R9 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrd1Q8C0R9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Lrrd1Q8C0R9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrd1Q8C0R9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrd1Q8C0R9 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Lrrd1Q8C0R9 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrd1Q8C0R9 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrd1Q8C0R9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrd1Q8C0R9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrd1Q8C0R9 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrd1Q8C0R9 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms