Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep55Q8BT07 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep55Q8BT07 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep55Q8BT07 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep55Q8BT07 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep55Q8BT07 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep55Q8BT07 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep55Q8BT07 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep55Q8BT07 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep55Q8BT07 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep55Q8BT07 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep55Q8BT07 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep55Q8BT07 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep55Q8BT07 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep55Q8BT07 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep55Q8BT07 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep55Q8BT07 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep55Q8BT07 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep55Q8BT07 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep55Q8BT07 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep55Q8BT07 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep55Q8BT07 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cep55Q8BT07 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cep55Q8BT07 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep55Q8BT07 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms