Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Htatsf1Q8BGC0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Htatsf1Q8BGC0 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Htatsf1Q8BGC0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms