Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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ChfrQ810L3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ChfrQ810L3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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ChfrQ810L3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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ChfrQ810L3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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ChfrQ810L3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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ChfrQ810L3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
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