Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms