Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpp38Q80UU2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms