Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rims3Q80U57 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms