Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms