Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Gm36287-201ENSMUST00000223481 796 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
ClmQ7TSN2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms