Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Dsg1bQ7TSF1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Dsg1bQ7TSF1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Dsg1bQ7TSF1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Dsg1bQ7TSF1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Dsg1bQ7TSF1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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