Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms