Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrc2bQ7TPM1 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms