Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Z0

Rtn4rl2, Reticulon-4 receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4rl2Q7M6Z0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rtn4rl2Q7M6Z0 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rtn4rl2Q7M6Z0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rtn4rl2Q7M6Z0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rtn4rl2Q7M6Z0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rtn4rl2Q7M6Z0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rtn4rl2Q7M6Z0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rtn4rl2Q7M6Z0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rtn4rl2Q7M6Z0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rtn4rl2Q7M6Z0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rtn4rl2Q7M6Z0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rtn4rl2Q7M6Z0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rtn4rl2Q7M6Z0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rtn4rl2Q7M6Z0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rtn4rl2Q7M6Z0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rtn4rl2Q7M6Z0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rtn4rl2Q7M6Z0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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