Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pdcl2Q78Y63 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pdcl2Q78Y63 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pdcl2Q78Y63 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Pdcl2Q78Y63 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms